對增值稅檢查時，查處的調增或調減增值稅稅額，應通過“應交稅費——增值稅檢查調整”專戶進行核算。該賬戶專門核算在增值稅檢查中查出的以前各期應補、應退的增值稅稅額，借方登記檢查調減的銷項稅額、檢查調增的進項稅額，貸方登記檢查調增的銷項稅額、檢查調減的進項稅額、檢查調增的進項稅額轉出及檢查調增的小規模納稅企業應交增值稅稅額，余額可能在貸方，也可能在借方，期末應對其余額按如下辦法進行處理：

　　若余額在借方，且“應交稅費——未交增值稅”（小規模企業為應交增值稅，下同）賬戶余額也在借方，則期末將“應交稅費——增值稅檢查調整”專戶借方余額直接轉入“應交稅費——未交增值稅”賬戶的借方。

　　若余額在借方，且“應交稅費——未交增值稅”賬戶余額在貸方，應比較兩者大小分別處理：當前者大于后者時，應在繳納了未交增值稅貸方余額后，將增值稅檢查調整專戶的借方余額轉入未交增值稅賬戶的借方；當后者大于前者時，應先將增值稅檢查調整專戶的借方余額轉到未交增值稅賬戶的借方，然后按兩者差額繳納增值稅稅款。

　　若余額在貸方，且“應交稅費——未交增值稅”賬戶余額也在貸方，則期末應將“應交稅費——增值稅檢查調整”專戶的貸方余額直接轉入“應交稅費——未交增值稅”賬戶的貸方，并按兩者之和繳納增值稅稅款。

　　著余額在貸方，且“應交稅費——未交增值稅”賬戶余額在借方，也應比較兩者的大小分別處理：當前者大于后者時，應將增值稅檢查調整專戶余額轉到未交增值稅賬戶的貸方，并按兩者的差額繳納增值稅稅款；當后者大于前者時，只能按增值稅檢查調整專戶的貸方余額，直接繳納增值稅稅款。

　　二、增值稅納稅檢查賬務調整的方法

　　第一，年終結賬前查補進項稅方面的賬務調整。（1）扣稅憑證取得不合法。如果取得的進項憑證不合法而企業抵扣了該進項稅，檢查發現后應做如下賬務調整：借記原材料、庫存商品等，貸記應交稅費——增值稅檢查調整。（2）抵扣范圍擅自擴大。企業購進用于非應稅項目的貨物不應抵扣進項稅額，如果企業進行了抵扣，檢查發現后應做如下賬務處理：借記應付職工薪酬等，貸記應交稅費——增值稅檢查調整。（3）非正常損失的貨物進項稅應轉出而未轉出。如外購貨物及在產品、產成品等發生的非正常損失，企業應負擔的進項稅應從進項稅額中轉出，經檢查發現未做轉出處理的，應做如下賬務處理：借記待處理財產損溢等，貸記應交稅費——增值稅檢查調整。（4）少抵扣進項稅額。在稅法規定的期限內，如果企業少抵扣了進項稅額，依照規定在計算出少抵扣的稅額后，做如下賬務處理：借記原材料等（紅字），貸記應交稅費——增值稅檢查調整（紅字）。

　　第二，年終結賬前查補銷項稅方面的賬務調整。（1）價外費用未計銷項稅額。如果企業價外向購貨方收取代收款項等符合稅法規定的各種性質的價外費用未計提銷項稅額的，應按新售貨物適用的稅率計算出應補的增值稅后，做如下賬務處理：借記其他應付款（代收、代墊款項）、本年利潤（價外費用款項），貸記應交稅費——增值稅檢查調整。（2）視同銷售業務未計銷項稅額。如果企業將自產的產品用于發放非貨幣性職工薪酬、無償贈與他人等發生的視同銷售業務未計提銷項稅額的，應按當期同類貨物的價格或按組成的計稅價格計算銷售額后計提銷項稅額，并進行如下賬務處理：借記應付職工薪酬、本年利潤（應計入損益的部分），貸記應交稅費——增值稅檢查調整。（3）適用稅率有誤。企業因稅率使用錯誤造成少計銷項稅的，借記本年利潤，貸記應交稅費——增值稅檢查調整；如果發生多計，則用紅字做上述分錄。

　　[例1]M企業系增值稅一般納稅人，增值稅稅率17％，20×8年6月份銷項稅額為30萬元，購進貨物的進項稅額為35萬元，“應交稅費——未交增值稅”賬戶借方余額為5萬元。20×8年7月10日，稅務機關對其檢查時發現以下業務會計處理有誤：6月4日，用自產的甲產品一批用于對外投資，成本價98萬元，無同類產品售價，成本利潤率為10％，企業做如下會計分錄：

　　借：長期股權投資 　　980000

　　　　貸：庫存商品 　　980000

　　6月22日，購進用于發放非貨幣性薪酬的商品52萬元，企業做如下會計分錄：

　　借：應付職工薪酬 　　444444.44

　　　　應交稅費——應交增值稅（進項稅額） 　　75555.56

　　　　貸：銀行存款 　　520000

　　對上述問題，應做如下查補稅的分錄：企業將自產的甲產品用于對外投資，應視同銷售業務，在無同類產品售價的情況下，按組成的計稅價格計算出銷項增值稅183260元[980000×（1+10％）×17％），調賬分錄如下：

　　借：長期股權投資等 　　183260

　　　　貸：應交稅費——增值稅檢查調整 　　183260

　　企業用于非應稅項目的貨物，其進項稅額不得抵扣。調賬分錄如下：

　　借：應付職工薪酬 　　75555.56

　　　　貸：應交稅費——增值稅檢查調整 　　75555.56

　　結轉“增值稅檢查調整”科目余額：

　　借：應交稅費——增值稅檢查調整 　　258815.56

　　　　貸：應交稅費——未交增值稅 　　258815.56

　　計算補交稅款=258815.56-50000=208815.56（元），做如下分錄：

　　借：應交稅費——未交增值稅 　　208815.56

　　　　貸：銀行存款 　　208815.56

　　第三，年終結賬后對以往年度增值稅查補的調整。對以前年度增值稅進行檢查補稅，如果涉及損益科目，應將查增、查減相抵后應補的增值稅，借記利潤分配——未分配利潤，貸記應交稅費——增值稅檢查調整；如果涉及非損益科目，按結賬前的有關賬務處理方法進行調整。

　　[例2]N公司系增值稅一般納稅人，適用17％的增值稅稅率、25％的所得稅稅率。20×9年7月3日稅務機關對該公司上年交納增值稅情況進行稽查，發現該企業20×5月業務會計處理有誤：將邊角料出售，取得收入價款123000元，企業會計分錄為：

　　借：銀行存款　　123000

　　　　貸：其他業務收入 　　123000

　　購進用于非應稅項目的固定資產（折舊期5年，無殘值），支付價款340000元，取得增值稅專用發票。企業賬務處理為：

　　借：固定資產 　　290598.29

　　　　應交稅費——應交增值稅（進項稅額） 　　49401.71

　　　　貸：銀行存款 　　340000

　　經稅務機關計算查補的增值稅額為：出售邊角料應補交增值稅17871.79元[123000÷（1+17％）×17％]，購進固定資產不得抵扣進項稅額49401.71元，兩項合計67273.50元。企業應按照會計差錯準則的要求進行賬務調整。

　　如果屬于非重大會計差錯，賬務處理如下：

　　借：固定資產 　　49401.71

　　　　其他業務收入 　　17871.79

　　　　貸：應交稅費——增值稅檢查調整 　　67273.50

　　20×8年6月至×9年6月，應補提固定資產折舊10703.70元（49401.70÷5÷12×13）。

　　借：管理費用 　　10703.70

　　　　貸：累計折舊 　　10703.70

　　如果屬于重大會計差錯，賬務處理如下：

　　借：以前年度損益調整 　　17871.79

　　　　固定資產49401.71

　　　　貸：應交稅費——增值稅檢查調整 　　67273.50

　　補提折舊：20×8年度5763.53元（49401.70÷5.12×7），20×9年度4940.17元（49401.70÷5÷12×6）。

　　借：以前年度損益調整　　5763.53

　　　　管理費用 　　4940.17

　　　　貸：累計折舊 　　10703.70

　　20×8年度多交企業所得稅5908.83元[（17871.79+5763.53）×25％]。

　　借：應交稅費——應交所得稅 　　5908.83

　　　　貸：以前年度損益調整 　　5908.83

　　借：利潤分配——未分配利潤 　　17726.49

　　　　貸：以前年度損益調整 　　17726.49

　　同時，企業還應相應調減盈余公積等項目的計提數并調整有關報表的年初余額。